Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms