Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC12.69□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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FAM3AP98173 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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FAM3AP98173 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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FAM3AP98173 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
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FAM3AP98173 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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FAM3AP98173 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
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FAM3AP98173 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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FAM3AP98173 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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FAM3AP98173 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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FAM3AP98173 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
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FAM3AP98173 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
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FAM3AP98173 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC12.68□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
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