Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
IRX1P78414 AC010536.1-201ENST00000538868 2611 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
IRX1P78414 RBM15-205ENST00000618772 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
IRX1P78414 STRIP2-202ENST00000435494 2866 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
IRX1P78414 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
IRX1P78414 CHD5-201ENST00000262450 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
IRX1P78414 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
IRX1P78414 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
IRX1P78414 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
IRX1P78414 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
IRX1P78414 DLGAP3-201ENST00000235180 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
IRX1P78414 AC107375.1-201ENST00000564464 2231 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
IRX1P78414 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
IRX1P78414 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
IRX1P78414 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
IRX1P78414 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
IRX1P78414 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
IRX1P78414 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
IRX1P78414 TP53TG5-201ENST00000372726 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
IRX1P78414 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
IRX1P78414 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
IRX1P78414 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
IRX1P78414 ACTN1-204ENST00000438964 3043 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
IRX1P78414 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
IRX1P78414 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
IRX1P78414 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
IRX1P78414 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
IRX1P78414 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
IRX1P78414 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
IRX1P78414 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
IRX1P78414 AL033529.1-201ENST00000480336 3447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
IRX1P78414 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
IRX1P78414 ADRA2B-201ENST00000620793 3371 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
IRX1P78414 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
IRX1P78414 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
IRX1P78414 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
IRX1P78414 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
IRX1P78414 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
IRX1P78414 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
IRX1P78414 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
IRX1P78414 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
IRX1P78414 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
IRX1P78414 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
IRX1P78414 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
IRX1P78414 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
IRX1P78414 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
IRX1P78414 KIAA1614-201ENST00000367587 3309 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
IRX1P78414 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
IRX1P78414 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
IRX1P78414 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
IRX1P78414 AL358933.1-201ENST00000565046 2830 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
IRX1P78414 KRT78-202ENST00000359499 2554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
IRX1P78414 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
IRX1P78414 BCAM-211ENST00000611077 3430 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
IRX1P78414 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
IRX1P78414 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
IRX1P78414 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
IRX1P78414 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
IRX1P78414 CTCFL-218ENST00000608440 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
IRX1P78414 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
IRX1P78414 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
IRX1P78414 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
IRX1P78414 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
IRX1P78414 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
IRX1P78414 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
IRX1P78414 DNAJB12-201ENST00000338820 4360 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
IRX1P78414 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
IRX1P78414 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
IRX1P78414 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
IRX1P78414 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
IRX1P78414 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
IRX1P78414 SUPT20HL1-201ENST00000436466 2618 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
IRX1P78414 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
IRX1P78414 CSF3R-201ENST00000331941 2375 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
IRX1P78414 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
IRX1P78414 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
IRX1P78414 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
IRX1P78414 RHOH-217ENST00000610353 2268 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
IRX1P78414 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
IRX1P78414 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
IRX1P78414 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
IRX1P78414 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
IRX1P78414 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
IRX1P78414 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
IRX1P78414 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
IRX1P78414 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
IRX1P78414 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
IRX1P78414 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
IRX1P78414 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
IRX1P78414 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
IRX1P78414 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
IRX1P78414 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
IRX1P78414 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
IRX1P78414 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
IRX1P78414 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
IRX1P78414 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
IRX1P78414 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
IRX1P78414 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
IRX1P78414 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
IRX1P78414 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms