Protein–RNA interactions for Protein: P78314

SH3BP2, SH3 domain-binding protein 2, humanhuman

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Length 561 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2P78314 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SH3BP2P78314 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SH3BP2P78314 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SH3BP2P78314 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SH3BP2P78314 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SH3BP2P78314 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SH3BP2P78314 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SH3BP2P78314 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SH3BP2P78314 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SH3BP2P78314 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SH3BP2P78314 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SH3BP2P78314 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SH3BP2P78314 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SH3BP2P78314 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SH3BP2P78314 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SH3BP2P78314 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SH3BP2P78314 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SH3BP2P78314 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SH3BP2P78314 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SH3BP2P78314 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SH3BP2P78314 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SH3BP2P78314 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SH3BP2P78314 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SH3BP2P78314 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SH3BP2P78314 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SH3BP2P78314 Z97985.1-201ENST00000332270 946 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SH3BP2P78314 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SH3BP2P78314 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SH3BP2P78314 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SH3BP2P78314 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SH3BP2P78314 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SH3BP2P78314 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SH3BP2P78314 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SH3BP2P78314 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SH3BP2P78314 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SH3BP2P78314 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SH3BP2P78314 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SH3BP2P78314 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SH3BP2P78314 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SH3BP2P78314 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SH3BP2P78314 AC121493.1-201ENST00000602316 450 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
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SH3BP2P78314 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SH3BP2P78314 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SH3BP2P78314 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SH3BP2P78314 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SH3BP2P78314 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SH3BP2P78314 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SH3BP2P78314 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SH3BP2P78314 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SH3BP2P78314 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SH3BP2P78314 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SH3BP2P78314 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SH3BP2P78314 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SH3BP2P78314 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SH3BP2P78314 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SH3BP2P78314 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SH3BP2P78314 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SH3BP2P78314 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SH3BP2P78314 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SH3BP2P78314 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SH3BP2P78314 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SH3BP2P78314 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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SH3BP2P78314 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SH3BP2P78314 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SH3BP2P78314 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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SH3BP2P78314 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SH3BP2P78314 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SH3BP2P78314 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SH3BP2P78314 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SH3BP2P78314 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SH3BP2P78314 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SH3BP2P78314 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SH3BP2P78314 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SH3BP2P78314 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SH3BP2P78314 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SH3BP2P78314 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SH3BP2P78314 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SH3BP2P78314 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SH3BP2P78314 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SH3BP2P78314 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SH3BP2P78314 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SH3BP2P78314 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SH3BP2P78314 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SH3BP2P78314 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SH3BP2P78314 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SH3BP2P78314 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SH3BP2P78314 AC073569.1-201ENST00000548469 667 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SH3BP2P78314 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SH3BP2P78314 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SH3BP2P78314 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SH3BP2P78314 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SH3BP2P78314 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SH3BP2P78314 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SH3BP2P78314 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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