Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 SCN5A-209ENST00000451551 8343 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 RIMKLA-202ENST00000431473 8909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 TIAF1-201ENST00000359450 5337 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 CALB1-201ENST00000265431 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 NLRP1-202ENST00000269280 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 CMC4-201ENST00000369479 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC10.29□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 ZNF519-206ENST00000589498 2117 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 ELN-222ENST00000458204 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 FN1-212ENST00000446046 7952 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 PRKCH-201ENST00000332981 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 CACNB1-202ENST00000394303 3742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 SLC2A14-213ENST00000539924 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 RUBCNL-201ENST00000378781 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 NFATC1-204ENST00000397790 3453 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 PKD1L2-210ENST00000533478 5669 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 SETDB2-203ENST00000354234 6139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 AC004846.1-201ENST00000554614 3050 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 KDM6A-201ENST00000377967 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 ESR1-201ENST00000206249 6458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 KCNAB1-215ENST00000618897 4437 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 TBC1D16-201ENST00000310924 10936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 BAK1-203ENST00000442998 2212 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 C12orf43-202ENST00000445832 2397 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 FBXL18-201ENST00000382368 3498 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 ARHGEF4-217ENST00000611048 3486 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 MAGED4B-201ENST00000335504 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 DLG5-201ENST00000372391 7415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 MRPL17-201ENST00000288937 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC10.28□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 HPX-201ENST00000265983 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 KLLN-201ENST00000445946 4277 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 GLIS3-202ENST00000381971 3961 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 KCNMA1-227ENST00000638203 3840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 ZNF701-204ENST00000540331 5538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 AC105345.1-202ENST00000382488 3204 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 SHPRH-201ENST00000275233 6649 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 XIRP1-202ENST00000396251 6040 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 HNF1A-201ENST00000257555 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 UBASH3B-201ENST00000284273 6912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 NPAS4-201ENST00000311034 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 TASP1-201ENST00000337743 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.4 ms