Protein–RNA interactions for Protein: P56750

CLDN17, Claudin-17, humanhuman

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN17P56750 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CLDN17P56750 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CLDN17P56750 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CLDN17P56750 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CLDN17P56750 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CLDN17P56750 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CLDN17P56750 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CLDN17P56750 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CLDN17P56750 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CLDN17P56750 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CLDN17P56750 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CLDN17P56750 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CLDN17P56750 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CLDN17P56750 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CLDN17P56750 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CLDN17P56750 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CLDN17P56750 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CLDN17P56750 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CLDN17P56750 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CLDN17P56750 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CLDN17P56750 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CLDN17P56750 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CLDN17P56750 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CLDN17P56750 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CLDN17P56750 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CLDN17P56750 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CLDN17P56750 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CLDN17P56750 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CLDN17P56750 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CLDN17P56750 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CLDN17P56750 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CLDN17P56750 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CLDN17P56750 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CLDN17P56750 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CLDN17P56750 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CLDN17P56750 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CLDN17P56750 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CLDN17P56750 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CLDN17P56750 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CLDN17P56750 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CLDN17P56750 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CLDN17P56750 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CLDN17P56750 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CLDN17P56750 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CLDN17P56750 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CLDN17P56750 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CLDN17P56750 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CLDN17P56750 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CLDN17P56750 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CLDN17P56750 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CLDN17P56750 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CLDN17P56750 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CLDN17P56750 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CLDN17P56750 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CLDN17P56750 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CLDN17P56750 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CLDN17P56750 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CLDN17P56750 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CLDN17P56750 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CLDN17P56750 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CLDN17P56750 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CLDN17P56750 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CLDN17P56750 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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CLDN17P56750 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CLDN17P56750 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CLDN17P56750 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CLDN17P56750 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CLDN17P56750 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CLDN17P56750 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CLDN17P56750 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CLDN17P56750 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CLDN17P56750 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CLDN17P56750 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CLDN17P56750 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CLDN17P56750 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CLDN17P56750 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CLDN17P56750 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CLDN17P56750 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CLDN17P56750 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CLDN17P56750 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CLDN17P56750 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CLDN17P56750 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CLDN17P56750 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CLDN17P56750 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CLDN17P56750 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CLDN17P56750 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CLDN17P56750 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CLDN17P56750 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CLDN17P56750 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CLDN17P56750 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CLDN17P56750 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CLDN17P56750 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CLDN17P56750 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CLDN17P56750 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CLDN17P56750 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CLDN17P56750 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CLDN17P56750 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CLDN17P56750 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CLDN17P56750 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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