Protein–RNA interactions for Protein: P48426

PIP4K2A, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2AP48426 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms