Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ME1P48163 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ME1P48163 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ME1P48163 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ME1P48163 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ME1P48163 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ME1P48163 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ME1P48163 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ME1P48163 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ME1P48163 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ME1P48163 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ME1P48163 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ME1P48163 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ME1P48163 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ME1P48163 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ME1P48163 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ME1P48163 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ME1P48163 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ME1P48163 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ME1P48163 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ME1P48163 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ME1P48163 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ME1P48163 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ME1P48163 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ME1P48163 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ME1P48163 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ME1P48163 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ME1P48163 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ME1P48163 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ME1P48163 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ME1P48163 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ME1P48163 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ME1P48163 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ME1P48163 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ME1P48163 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ME1P48163 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ME1P48163 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ME1P48163 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ME1P48163 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ME1P48163 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ME1P48163 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ME1P48163 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ME1P48163 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ME1P48163 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ME1P48163 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ME1P48163 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ME1P48163 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ME1P48163 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ME1P48163 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ME1P48163 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ME1P48163 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ME1P48163 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ME1P48163 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ME1P48163 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ME1P48163 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ME1P48163 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ME1P48163 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ME1P48163 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ME1P48163 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ME1P48163 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ME1P48163 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ME1P48163 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ME1P48163 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ME1P48163 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ME1P48163 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ME1P48163 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ME1P48163 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ME1P48163 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ME1P48163 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ME1P48163 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ME1P48163 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ME1P48163 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ME1P48163 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ME1P48163 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ME1P48163 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ME1P48163 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ME1P48163 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ME1P48163 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ME1P48163 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ME1P48163 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ME1P48163 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ME1P48163 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ME1P48163 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ME1P48163 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ME1P48163 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ME1P48163 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ME1P48163 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ME1P48163 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ME1P48163 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ME1P48163 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ME1P48163 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ME1P48163 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ME1P48163 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ME1P48163 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ME1P48163 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ME1P48163 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ME1P48163 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ME1P48163 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ME1P48163 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ME1P48163 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms