Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

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Length 330 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXC13P31276 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXC13P31276 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXC13P31276 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXC13P31276 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXC13P31276 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXC13P31276 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXC13P31276 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXC13P31276 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXC13P31276 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXC13P31276 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXC13P31276 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXC13P31276 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXC13P31276 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
HOXC13P31276 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXC13P31276 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HOXC13P31276 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXC13P31276 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXC13P31276 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXC13P31276 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXC13P31276 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXC13P31276 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXC13P31276 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HOXC13P31276 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
HOXC13P31276 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
HOXC13P31276 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
HOXC13P31276 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXC13P31276 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
HOXC13P31276 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
HOXC13P31276 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC15□□□□□ -0.01
HOXC13P31276 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HOXC13P31276 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC15□□□□□ -0.01
HOXC13P31276 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXC13P31276 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC15□□□□□ -0.01
HOXC13P31276 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
HOXC13P31276 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXC13P31276 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXC13P31276 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HOXC13P31276 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXC13P31276 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HOXC13P31276 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXC13P31276 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
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HOXC13P31276 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXC13P31276 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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HOXC13P31276 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXC13P31276 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXC13P31276 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXC13P31276 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
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HOXC13P31276 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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HOXC13P31276 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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HOXC13P31276 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXC13P31276 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXC13P31276 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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HOXC13P31276 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXC13P31276 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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HOXC13P31276 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HOXC13P31276 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HOXC13P31276 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HOXC13P31276 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HOXC13P31276 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HOXC13P31276 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HOXC13P31276 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HOXC13P31276 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HOXC13P31276 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HOXC13P31276 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HOXC13P31276 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HOXC13P31276 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
HOXC13P31276 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HOXC13P31276 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HOXC13P31276 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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