Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ARID4AP29374 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ARID4AP29374 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ARID4AP29374 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ARID4AP29374 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ARID4AP29374 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ARID4AP29374 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ARID4AP29374 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ARID4AP29374 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ARID4AP29374 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ARID4AP29374 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ARID4AP29374 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ARID4AP29374 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ARID4AP29374 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ARID4AP29374 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ARID4AP29374 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ARID4AP29374 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ARID4AP29374 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ARID4AP29374 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ARID4AP29374 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ARID4AP29374 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ARID4AP29374 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ARID4AP29374 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ARID4AP29374 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ARID4AP29374 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ARID4AP29374 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ARID4AP29374 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ARID4AP29374 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARID4AP29374 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARID4AP29374 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARID4AP29374 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARID4AP29374 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARID4AP29374 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARID4AP29374 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARID4AP29374 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARID4AP29374 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARID4AP29374 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARID4AP29374 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARID4AP29374 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARID4AP29374 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARID4AP29374 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARID4AP29374 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARID4AP29374 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ARID4AP29374 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARID4AP29374 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARID4AP29374 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARID4AP29374 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARID4AP29374 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARID4AP29374 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ARID4AP29374 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARID4AP29374 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARID4AP29374 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ARID4AP29374 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARID4AP29374 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ARID4AP29374 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARID4AP29374 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARID4AP29374 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ARID4AP29374 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ARID4AP29374 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARID4AP29374 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARID4AP29374 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ARID4AP29374 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARID4AP29374 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARID4AP29374 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARID4AP29374 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARID4AP29374 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARID4AP29374 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARID4AP29374 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARID4AP29374 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARID4AP29374 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARID4AP29374 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARID4AP29374 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARID4AP29374 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARID4AP29374 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARID4AP29374 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARID4AP29374 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARID4AP29374 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARID4AP29374 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARID4AP29374 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARID4AP29374 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARID4AP29374 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARID4AP29374 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARID4AP29374 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARID4AP29374 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARID4AP29374 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARID4AP29374 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARID4AP29374 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARID4AP29374 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARID4AP29374 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARID4AP29374 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARID4AP29374 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARID4AP29374 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARID4AP29374 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARID4AP29374 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARID4AP29374 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARID4AP29374 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARID4AP29374 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARID4AP29374 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARID4AP29374 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARID4AP29374 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms