Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PLNP26678 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PLNP26678 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PLNP26678 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PLNP26678 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PLNP26678 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PLNP26678 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PLNP26678 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PLNP26678 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PLNP26678 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PLNP26678 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PLNP26678 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PLNP26678 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PLNP26678 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PLNP26678 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PLNP26678 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PLNP26678 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PLNP26678 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PLNP26678 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PLNP26678 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PLNP26678 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PLNP26678 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PLNP26678 EIF2AK1-201ENST00000199389 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PLNP26678 COG1-201ENST00000299886 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PLNP26678 PITPNM3-202ENST00000421306 6945 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PLNP26678 STRA6-222ENST00000616000 2843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PLNP26678 ESYT1-202ENST00000394048 4388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PLNP26678 ANKZF1-201ENST00000323348 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PLNP26678 CTCFL-208ENST00000432255 2955 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PLNP26678 SIRT2-201ENST00000249396 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PLNP26678 SIRT2-204ENST00000392081 2062 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PLNP26678 ATP7B-202ENST00000344297 5861 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PLNP26678 GMPS-203ENST00000496455 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PLNP26678 C1S-202ENST00000360817 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PLNP26678 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PLNP26678 CARS-214ENST00000529772 2637 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PLNP26678 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PLNP26678 CHD4-211ENST00000544484 6554 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PLNP26678 IKZF1-211ENST00000440768 5511 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PLNP26678 IFT172-203ENST00000416524 1982 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PLNP26678 ABCB7-203ENST00000373394 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PLNP26678 AGAP12P-201ENST00000585227 2359 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
PLNP26678 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
PLNP26678 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PLNP26678 PPP1R11-205ENST00000376772 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PLNP26678 PRKAR2A-202ENST00000296446 3318 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PLNP26678 VWA8-203ENST00000379310 7147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PLNP26678 TVP23C-CDRT4-203ENST00000522212 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PLNP26678 KCNS2-202ENST00000521839 4340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PLNP26678 ETS2-201ENST00000360214 3936 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PLNP26678 AGGF1P10-201ENST00000635005 2191 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
PLNP26678 PHF21B-201ENST00000313237 3671 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PLNP26678 WDR47-204ENST00000369965 4240 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PLNP26678 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PLNP26678 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PLNP26678 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PLNP26678 ZBTB49-201ENST00000337872 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PLNP26678 KCTD9-201ENST00000221200 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PLNP26678 PTPRG-201ENST00000295874 4650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PLNP26678 ZFAT-209ENST00000520727 4686 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PLNP26678 PAX7-203ENST00000420770 5538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PLNP26678 NHEJ1-201ENST00000356853 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PLNP26678 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PLNP26678 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PLNP26678 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PLNP26678 ATXN2L-225ENST00000570200 3635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PLNP26678 ZNF180-201ENST00000221327 4335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PLNP26678 PRKAB1-205ENST00000540121 1673 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PLNP26678 GOLGA3-201ENST00000204726 9252 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PLNP26678 BCL2L13-202ENST00000337612 4905 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PLNP26678 CANX-202ENST00000452673 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PLNP26678 MYCBP-201ENST00000397572 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PLNP26678 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PLNP26678 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PLNP26678 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PLNP26678 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PLNP26678 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PLNP26678 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PLNP26678 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PLNP26678 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PLNP26678 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PLNP26678 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
PLNP26678 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PLNP26678 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PLNP26678 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PLNP26678 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PLNP26678 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PLNP26678 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PLNP26678 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PLNP26678 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PLNP26678 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PLNP26678 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PLNP26678 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
PLNP26678 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
PLNP26678 CASC4-201ENST00000299957 3962 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PLNP26678 DHX30-201ENST00000348968 3994 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PLNP26678 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PLNP26678 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PLNP26678 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PLNP26678 NCSTN-202ENST00000368063 3031 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms