Protein–RNA interactions for Protein: P23219

PTGS1, Prostaglandin G/H synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGS1P23219 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTGS1P23219 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTGS1P23219 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTGS1P23219 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTGS1P23219 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTGS1P23219 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTGS1P23219 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 644.8 ms