Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
CXCL3P19876 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
CXCL3P19876 PCID2-205ENST00000375477 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CXCL3P19876 EPHA1-201ENST00000275815 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CXCL3P19876 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CXCL3P19876 NT5DC4-201ENST00000327581 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CXCL3P19876 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CXCL3P19876 CDK20-209ENST00000605159 1860 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CXCL3P19876 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CXCL3P19876 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
CXCL3P19876 KCNMA1-210ENST00000404771 4014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CXCL3P19876 KLC2-206ENST00000417856 3015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CXCL3P19876 DPP8-201ENST00000300141 3139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CXCL3P19876 COG6-202ENST00000416691 5257 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CXCL3P19876 OCA2-202ENST00000354638 3186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CXCL3P19876 ABL2-207ENST00000507173 3177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CXCL3P19876 C9orf170-201ENST00000623052 3239 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CXCL3P19876 SLC47A1-201ENST00000270570 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CXCL3P19876 TLE3-220ENST00000559929 3408 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CXCL3P19876 LINC01749-202ENST00000607802 3408 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CXCL3P19876 MYO1D-206ENST00000579584 3500 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CXCL3P19876 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CXCL3P19876 ARAF-203ENST00000377045 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CXCL3P19876 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CXCL3P19876 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CXCL3P19876 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CXCL3P19876 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CXCL3P19876 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CXCL3P19876 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CXCL3P19876 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CXCL3P19876 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CXCL3P19876 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CXCL3P19876 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CXCL3P19876 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CXCL3P19876 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CXCL3P19876 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CXCL3P19876 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CXCL3P19876 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CXCL3P19876 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CXCL3P19876 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CXCL3P19876 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
CXCL3P19876 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CXCL3P19876 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CXCL3P19876 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CXCL3P19876 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CXCL3P19876 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CXCL3P19876 BCL2L1-203ENST00000376062 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CXCL3P19876 WDR92-201ENST00000295121 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CXCL3P19876 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CXCL3P19876 RNF214-201ENST00000300650 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CXCL3P19876 ALDH1L1-205ENST00000452905 2758 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CXCL3P19876 ARHGAP45-210ENST00000590214 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CXCL3P19876 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CXCL3P19876 KCNIP3-201ENST00000295225 2940 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CXCL3P19876 ILF3-201ENST00000250241 3035 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CXCL3P19876 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CXCL3P19876 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CXCL3P19876 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CXCL3P19876 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CXCL3P19876 ENG-201ENST00000344849 3059 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CXCL3P19876 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CXCL3P19876 AC092117.1-201ENST00000621230 3250 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
CXCL3P19876 TSN-201ENST00000389682 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CXCL3P19876 SESN2-201ENST00000253063 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CXCL3P19876 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CXCL3P19876 BNIP3L-201ENST00000380629 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CXCL3P19876 AP3M2-207ENST00000518421 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CXCL3P19876 ZNF124-202ENST00000472531 2243 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CXCL3P19876 C12orf76-205ENST00000548191 2204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CXCL3P19876 UBE2W-201ENST00000419880 2315 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CXCL3P19876 AC241585.2-201ENST00000578899 2307 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CXCL3P19876 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CXCL3P19876 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CXCL3P19876 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
CXCL3P19876 ACTN1-202ENST00000376839 2824 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
CXCL3P19876 NOP2-212ENST00000541778 3038 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
CXCL3P19876 RSPO2-201ENST00000276659 3111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CXCL3P19876 LLGL1-203ENST00000621229 3187 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
CXCL3P19876 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CXCL3P19876 CATSPERE-203ENST00000366534 3333 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
CXCL3P19876 CMIP-208ENST00000566462 3512 ntTSL 4 BASIC12.24□□□□□ -0.45
CXCL3P19876 SNX22-201ENST00000325881 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CXCL3P19876 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CXCL3P19876 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CXCL3P19876 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CXCL3P19876 SRP54-201ENST00000216774 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CXCL3P19876 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CXCL3P19876 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CXCL3P19876 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CXCL3P19876 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CXCL3P19876 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CXCL3P19876 HLA-E-201ENST00000376630 2601 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
CXCL3P19876 FGFR1-207ENST00000397103 2953 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
CXCL3P19876 DQX1-202ENST00000404568 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
CXCL3P19876 RCAN2-204ENST00000405162 2457 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
CXCL3P19876 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
CXCL3P19876 IL10-202ENST00000423557 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CXCL3P19876 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
CXCL3P19876 CASS4-202ENST00000434344 2888 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
CXCL3P19876 BUB1B-PAK6-201ENST00000441369 2767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
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