Protein–RNA interactions for Protein: P19875

CXCL2, C-X-C motif chemokine 2, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL2P19875 ZNF185-205ENST00000370270 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CXCL2P19875 REXO5-208ENST00000564274 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CXCL2P19875 OCA2-202ENST00000354638 3186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CXCL2P19875 CSNK1G1-205ENST00000607537 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CXCL2P19875 TRIM35-201ENST00000305364 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CXCL2P19875 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CXCL2P19875 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CXCL2P19875 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CXCL2P19875 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CXCL2P19875 FRMD1-205ENST00000440994 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.47
CXCL2P19875 BDH1-203ENST00000392379 3546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
CXCL2P19875 NDRG4-236ENST00000566192 3265 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
CXCL2P19875 EPM2A-207ENST00000611340 2786 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 SRP54-201ENST00000216774 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 DAO-201ENST00000228476 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 ELN-204ENST00000357036 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 MAGED1-201ENST00000326587 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 ESRRB-201ENST00000380887 2745 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 COG6-202ENST00000416691 5257 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 NFKB1-202ENST00000394820 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 PAK3-211ENST00000518291 2098 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC12.08□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
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CXCL2P19875 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 NLRP2-202ENST00000339757 3422 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 DFFB-205ENST00000378209 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 CARHSP1-202ENST00000396593 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 ATXN2L-205ENST00000395547 3981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 KLC4-203ENST00000394056 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
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CXCL2P19875 SPINT1-201ENST00000344051 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 SLC25A35-203ENST00000579192 2136 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 C9orf170-201ENST00000623052 3239 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 LOXL4-201ENST00000260702 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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CXCL2P19875 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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CXCL2P19875 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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CXCL2P19875 EME1-202ENST00000393271 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 ACTN1-202ENST00000376839 2824 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 ZNF473-203ENST00000445728 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
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CXCL2P19875 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 WDR92-201ENST00000295121 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 SH2D7-201ENST00000328828 2750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 FAM102A-202ENST00000373084 3352 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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