Protein–RNA interactions for Protein: P11712

CYP2C9, Cytochrome P450 2C9, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP2C9P11712 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms