Protein–RNA interactions for Protein: P06454

PTMA, Prothymosin alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTMAP06454 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTMAP06454 IL11RA-208ENST00000555003 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTMAP06454 SEC31A-205ENST00000395310 4259 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTMAP06454 CYB5D1-203ENST00000571846 1870 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTMAP06454 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTMAP06454 DNAJA4-203ENST00000394855 3245 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTMAP06454 PRPF40B-209ENST00000548825 3307 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTMAP06454 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTMAP06454 PCCB-210ENST00000471595 6090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTMAP06454 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTMAP06454 TRPM5-202ENST00000528453 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTMAP06454 INCENP-201ENST00000278849 3698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTMAP06454 NCBP1-202ENST00000375147 5178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTMAP06454 SRRM1-201ENST00000323848 4011 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTMAP06454 TRIM69-206ENST00000559390 2486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTMAP06454 XRRA1-207ENST00000527087 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTMAP06454 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTMAP06454 COL6A3-203ENST00000353578 9963 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTMAP06454 OPRK1-201ENST00000265572 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTMAP06454 SLX4-201ENST00000294008 7307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTMAP06454 SEZ6L-201ENST00000248933 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTMAP06454 SEZ6L-210ENST00000629590 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTMAP06454 SPATA13-203ENST00000382108 8463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTMAP06454 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTMAP06454 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTMAP06454 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTMAP06454 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTMAP06454 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTMAP06454 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTMAP06454 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTMAP06454 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTMAP06454 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PTMAP06454 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTMAP06454 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTMAP06454 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTMAP06454 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTMAP06454 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTMAP06454 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PTMAP06454 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PTMAP06454 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTMAP06454 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTMAP06454 FAM78A-203ENST00000372271 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTMAP06454 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTMAP06454 KCND1-201ENST00000218176 4437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTMAP06454 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTMAP06454 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTMAP06454 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PTMAP06454 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTMAP06454 PIK3AP1-201ENST00000339364 4803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTMAP06454 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTMAP06454 SLC4A1-201ENST00000262418 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTMAP06454 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTMAP06454 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTMAP06454 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTMAP06454 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTMAP06454 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTMAP06454 MAGI1-217ENST00000611645 6398 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTMAP06454 SUPT7L-203ENST00000405491 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTMAP06454 XIRP1-203ENST00000421646 2596 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTMAP06454 TAPBP-234ENST00000434618 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTMAP06454 PRR26-201ENST00000381489 7250 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTMAP06454 CEP78-205ENST00000424347 11198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTMAP06454 ACO1-203ENST00000541043 3618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTMAP06454 ATXN2L-225ENST00000570200 3635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTMAP06454 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTMAP06454 BCL2-201ENST00000333681 3209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTMAP06454 NISCH-212ENST00000488380 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTMAP06454 PLA2G4B-201ENST00000452633 2985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTMAP06454 EPN2-205ENST00000395626 2863 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTMAP06454 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTMAP06454 CACNA1G-207ENST00000429973 7120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTMAP06454 CACNA1G-217ENST00000507336 7116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTMAP06454 TBCE-207ENST00000543662 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTMAP06454 AMT-221ENST00000538581 2038 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTMAP06454 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PTMAP06454 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PTMAP06454 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTMAP06454 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTMAP06454 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTMAP06454 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTMAP06454 C10orf105-202ENST00000441508 4836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTMAP06454 LRPAP1-202ENST00000500728 7819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTMAP06454 SRC-204ENST00000373578 4630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTMAP06454 MKL1-211ENST00000618196 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTMAP06454 EMBP1-203ENST00000622787 4235 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTMAP06454 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTMAP06454 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTMAP06454 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTMAP06454 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTMAP06454 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTMAP06454 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTMAP06454 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PTMAP06454 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTMAP06454 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTMAP06454 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTMAP06454 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTMAP06454 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTMAP06454 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTMAP06454 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTMAP06454 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms