Protein–RNA interactions for Protein: P02545

LMNA, Prelamin-A/C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNAP02545 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMNAP02545 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LMNAP02545 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LMNAP02545 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMNAP02545 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMNAP02545 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMNAP02545 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMNAP02545 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMNAP02545 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMNAP02545 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMNAP02545 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMNAP02545 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMNAP02545 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMNAP02545 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMNAP02545 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMNAP02545 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMNAP02545 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMNAP02545 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMNAP02545 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMNAP02545 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMNAP02545 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMNAP02545 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMNAP02545 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMNAP02545 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMNAP02545 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMNAP02545 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMNAP02545 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMNAP02545 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMNAP02545 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMNAP02545 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMNAP02545 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMNAP02545 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMNAP02545 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMNAP02545 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMNAP02545 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LMNAP02545 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMNAP02545 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMNAP02545 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMNAP02545 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMNAP02545 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMNAP02545 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMNAP02545 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMNAP02545 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMNAP02545 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMNAP02545 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMNAP02545 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMNAP02545 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LMNAP02545 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMNAP02545 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMNAP02545 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMNAP02545 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMNAP02545 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMNAP02545 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMNAP02545 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMNAP02545 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMNAP02545 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMNAP02545 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LMNAP02545 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LMNAP02545 AC148477.9-201ENST00000623974 539 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LMNAP02545 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMNAP02545 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMNAP02545 CASP16P-204ENST00000635032 809 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LMNAP02545 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMNAP02545 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMNAP02545 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMNAP02545 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMNAP02545 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMNAP02545 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LMNAP02545 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMNAP02545 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMNAP02545 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMNAP02545 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMNAP02545 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMNAP02545 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMNAP02545 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LMNAP02545 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMNAP02545 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMNAP02545 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMNAP02545 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMNAP02545 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMNAP02545 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMNAP02545 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMNAP02545 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMNAP02545 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMNAP02545 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMNAP02545 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMNAP02545 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMNAP02545 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMNAP02545 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMNAP02545 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMNAP02545 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMNAP02545 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMNAP02545 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMNAP02545 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMNAP02545 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMNAP02545 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMNAP02545 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMNAP02545 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMNAP02545 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMNAP02545 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms