Protein–RNA interactions for Protein: P01574

IFNB1, Interferon beta, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNB1P01574 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 TRMT1L-201ENST00000367506 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 AC025594.2-201ENST00000609480 3902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms