Protein–RNA interactions for Protein: O43852

CALU, Calumenin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALUO43852 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CALUO43852 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CALUO43852 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CALUO43852 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CALUO43852 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CALUO43852 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CALUO43852 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CALUO43852 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CALUO43852 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CALUO43852 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CALUO43852 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CALUO43852 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CALUO43852 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALUO43852 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALUO43852 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALUO43852 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALUO43852 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALUO43852 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALUO43852 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALUO43852 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALUO43852 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALUO43852 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALUO43852 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALUO43852 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALUO43852 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALUO43852 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALUO43852 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALUO43852 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALUO43852 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CALUO43852 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALUO43852 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CALUO43852 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALUO43852 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALUO43852 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CALUO43852 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALUO43852 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALUO43852 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALUO43852 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALUO43852 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALUO43852 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALUO43852 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALUO43852 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALUO43852 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALUO43852 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALUO43852 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALUO43852 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALUO43852 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALUO43852 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALUO43852 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALUO43852 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALUO43852 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALUO43852 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CALUO43852 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CALUO43852 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CALUO43852 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CALUO43852 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CALUO43852 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CALUO43852 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CALUO43852 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CALUO43852 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CALUO43852 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CALUO43852 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CALUO43852 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CALUO43852 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CALUO43852 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CALUO43852 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CALUO43852 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CALUO43852 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CALUO43852 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CALUO43852 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CALUO43852 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CALUO43852 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CALUO43852 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CALUO43852 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CALUO43852 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CALUO43852 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CALUO43852 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CALUO43852 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CALUO43852 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CALUO43852 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CALUO43852 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CALUO43852 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CALUO43852 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CALUO43852 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CALUO43852 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CALUO43852 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CALUO43852 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CALUO43852 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CALUO43852 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CALUO43852 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CALUO43852 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CALUO43852 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CALUO43852 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CALUO43852 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CALUO43852 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CALUO43852 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CALUO43852 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CALUO43852 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CALUO43852 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CALUO43852 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms