Protein–RNA interactions for Protein: O43823

AKAP8, A-kinase anchor protein 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 692 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AKAP8O43823 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
AKAP8O43823 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
AKAP8O43823 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
AKAP8O43823 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
AKAP8O43823 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
AKAP8O43823 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
AKAP8O43823 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
AKAP8O43823 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
AKAP8O43823 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
AKAP8O43823 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
AKAP8O43823 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
AKAP8O43823 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
AKAP8O43823 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
AKAP8O43823 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
AKAP8O43823 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
AKAP8O43823 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
AKAP8O43823 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
AKAP8O43823 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
AKAP8O43823 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
AKAP8O43823 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
AKAP8O43823 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
AKAP8O43823 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
AKAP8O43823 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
AKAP8O43823 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
AKAP8O43823 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
AKAP8O43823 GRWD1-201ENST00000253237 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
AKAP8O43823 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
AKAP8O43823 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
AKAP8O43823 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
AKAP8O43823 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
AKAP8O43823 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
AKAP8O43823 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
AKAP8O43823 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
AKAP8O43823 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
AKAP8O43823 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
AKAP8O43823 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
AKAP8O43823 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
AKAP8O43823 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
AKAP8O43823 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
AKAP8O43823 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
AKAP8O43823 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
AKAP8O43823 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
AKAP8O43823 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
AKAP8O43823 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
AKAP8O43823 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
AKAP8O43823 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
AKAP8O43823 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
AKAP8O43823 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
AKAP8O43823 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
AKAP8O43823 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
AKAP8O43823 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
AKAP8O43823 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
AKAP8O43823 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
AKAP8O43823 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
AKAP8O43823 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
AKAP8O43823 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
AKAP8O43823 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
AKAP8O43823 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
AKAP8O43823 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
AKAP8O43823 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
AKAP8O43823 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
AKAP8O43823 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
AKAP8O43823 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
AKAP8O43823 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
AKAP8O43823 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
AKAP8O43823 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
AKAP8O43823 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
AKAP8O43823 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
AKAP8O43823 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
AKAP8O43823 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
AKAP8O43823 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
AKAP8O43823 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
AKAP8O43823 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
AKAP8O43823 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
AKAP8O43823 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
AKAP8O43823 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
AKAP8O43823 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
AKAP8O43823 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
AKAP8O43823 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AKAP8O43823 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AKAP8O43823 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AKAP8O43823 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
AKAP8O43823 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
AKAP8O43823 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
AKAP8O43823 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AKAP8O43823 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AKAP8O43823 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AKAP8O43823 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AKAP8O43823 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AKAP8O43823 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
AKAP8O43823 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AKAP8O43823 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AKAP8O43823 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
AKAP8O43823 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
AKAP8O43823 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
AKAP8O43823 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AKAP8O43823 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AKAP8O43823 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AKAP8O43823 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
AKAP8O43823 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms