Protein–RNA interactions for Protein: O15178

T, Brachyury protein, humanhuman

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Length 435 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TO15178 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TO15178 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TO15178 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TO15178 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TO15178 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TO15178 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TO15178 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TO15178 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TO15178 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TO15178 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
TO15178 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TO15178 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TO15178 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TO15178 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TO15178 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TO15178 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TO15178 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TO15178 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TO15178 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TO15178 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TO15178 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TO15178 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TO15178 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
TO15178 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TO15178 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TO15178 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TO15178 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TO15178 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TO15178 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TO15178 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TO15178 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TO15178 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TO15178 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TO15178 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TO15178 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TO15178 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TO15178 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TO15178 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TO15178 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TO15178 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TO15178 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TO15178 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
TO15178 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
TO15178 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TO15178 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
TO15178 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TO15178 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TO15178 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TO15178 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TO15178 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TO15178 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TO15178 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
TO15178 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
TO15178 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TO15178 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TO15178 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TO15178 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TO15178 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
TO15178 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TO15178 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TO15178 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TO15178 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TO15178 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
TO15178 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TO15178 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TO15178 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TO15178 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TO15178 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TO15178 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TO15178 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TO15178 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TO15178 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TO15178 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
TO15178 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TO15178 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TO15178 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TO15178 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TO15178 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TO15178 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TO15178 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TO15178 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TO15178 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TO15178 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TO15178 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TO15178 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
TO15178 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
TO15178 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TO15178 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
TO15178 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
TO15178 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TO15178 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TO15178 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TO15178 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
TO15178 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
TO15178 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TO15178 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TO15178 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TO15178 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TO15178 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TO15178 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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