Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 HTATIP2-202ENST00000421577 886 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 AC093673.1-201ENST00000429630 648 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 RPL9-203ENST00000449470 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 FAM86B3P-203ENST00000523992 854 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 DUXAP9-201ENST00000547220 665 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 FOXN3-AS2-201ENST00000554071 1262 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 ZNRD1-203ENST00000376782 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 CCL24-202ENST00000416943 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 DMKN-256ENST00000492341 738 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 YPEL4-209ENST00000534711 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 COX5A-205ENST00000568517 582 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 C17orf62-216ENST00000578919 841 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 AC093567.1-201ENST00000590649 877 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 ASGR1-209ENST00000619926 1384 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 NCF4-202ENST00000397147 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 GOLGA8K-202ENST00000512626 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 PGAM2-201ENST00000297283 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms