Protein–RNA interactions for Protein: A4FU01

MTMR11, Myotubularin-related protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR11A4FU01 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.2 ms