Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

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Length 203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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HDGFL3Q9Y3E1 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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HDGFL3Q9Y3E1 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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HDGFL3Q9Y3E1 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
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