Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HPS5Q9UPZ3 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HPS5Q9UPZ3 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HPS5Q9UPZ3 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HPS5Q9UPZ3 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HPS5Q9UPZ3 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HPS5Q9UPZ3 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
HPS5Q9UPZ3 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HPS5Q9UPZ3 AC012368.2-201ENST00000423539 560 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HPS5Q9UPZ3 EHMT2-AS1-201ENST00000434689 373 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HPS5Q9UPZ3 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HPS5Q9UPZ3 FAM86KP-201ENST00000509817 987 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
HPS5Q9UPZ3 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HPS5Q9UPZ3 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HPS5Q9UPZ3 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HPS5Q9UPZ3 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
HPS5Q9UPZ3 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HPS5Q9UPZ3 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HPS5Q9UPZ3 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HPS5Q9UPZ3 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HPS5Q9UPZ3 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HPS5Q9UPZ3 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HPS5Q9UPZ3 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HPS5Q9UPZ3 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HPS5Q9UPZ3 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HPS5Q9UPZ3 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HPS5Q9UPZ3 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HPS5Q9UPZ3 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HPS5Q9UPZ3 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HPS5Q9UPZ3 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HPS5Q9UPZ3 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HPS5Q9UPZ3 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HPS5Q9UPZ3 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HPS5Q9UPZ3 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HPS5Q9UPZ3 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HPS5Q9UPZ3 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HPS5Q9UPZ3 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HPS5Q9UPZ3 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HPS5Q9UPZ3 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HPS5Q9UPZ3 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
HPS5Q9UPZ3 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HPS5Q9UPZ3 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HPS5Q9UPZ3 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HPS5Q9UPZ3 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HPS5Q9UPZ3 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HPS5Q9UPZ3 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HPS5Q9UPZ3 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HPS5Q9UPZ3 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HPS5Q9UPZ3 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HPS5Q9UPZ3 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HPS5Q9UPZ3 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HPS5Q9UPZ3 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HPS5Q9UPZ3 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HPS5Q9UPZ3 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HPS5Q9UPZ3 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HPS5Q9UPZ3 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HPS5Q9UPZ3 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HPS5Q9UPZ3 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HPS5Q9UPZ3 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HPS5Q9UPZ3 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HPS5Q9UPZ3 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HPS5Q9UPZ3 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HPS5Q9UPZ3 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HPS5Q9UPZ3 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HPS5Q9UPZ3 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HPS5Q9UPZ3 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HPS5Q9UPZ3 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HPS5Q9UPZ3 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HPS5Q9UPZ3 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HPS5Q9UPZ3 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
HPS5Q9UPZ3 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HPS5Q9UPZ3 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HPS5Q9UPZ3 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HPS5Q9UPZ3 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HPS5Q9UPZ3 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HPS5Q9UPZ3 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HPS5Q9UPZ3 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HPS5Q9UPZ3 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HPS5Q9UPZ3 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HPS5Q9UPZ3 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
HPS5Q9UPZ3 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
HPS5Q9UPZ3 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HPS5Q9UPZ3 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HPS5Q9UPZ3 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
HPS5Q9UPZ3 HIGD1A-203ENST00000430190 741 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HPS5Q9UPZ3 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HPS5Q9UPZ3 DDX39AP1-201ENST00000445147 1181 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
HPS5Q9UPZ3 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
HPS5Q9UPZ3 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HPS5Q9UPZ3 AL118516.1-201ENST00000564152 670 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
HPS5Q9UPZ3 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
HPS5Q9UPZ3 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
HPS5Q9UPZ3 AP001029.1-201ENST00000589843 168 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HPS5Q9UPZ3 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HPS5Q9UPZ3 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
HPS5Q9UPZ3 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HPS5Q9UPZ3 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HPS5Q9UPZ3 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HPS5Q9UPZ3 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HPS5Q9UPZ3 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms