Protein–RNA interactions for Protein: Q9P298

HIGD1B, HIG1 domain family member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD1BQ9P298 AC009549.1-201ENST00000603468 1686 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 CELF4-218ENST00000591287 3757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 YWHAE-201ENST00000264335 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 DNM3-201ENST00000355305 3280 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 NRXN1-210ENST00000406316 9375 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 PCSK2-202ENST00000377899 4674 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 GNPNAT1-201ENST00000216410 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 MCC-201ENST00000302475 8257 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 RAB27A-201ENST00000336787 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 OGFR-202ENST00000370461 4506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 PSKH1-201ENST00000291041 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 CCDC114-201ENST00000315396 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 FOXN4-202ENST00000355216 2958 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 VMP1-201ENST00000262291 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 CNOT7-211ENST00000523917 1885 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 RFX5-202ENST00000368870 2459 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 INCENP-201ENST00000278849 3698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 RAB11FIP1-202ENST00000330843 7811 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 GPR12-202ENST00000405846 4850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 PRAME-201ENST00000398741 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 BHMT-201ENST00000274353 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 ALK-205ENST00000618119 4646 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 ARHGAP35-206ENST00000614079 7696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 NLRP2-201ENST00000263437 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 AC009123.1-202ENST00000565643 2551 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 AC092902.2-210ENST00000468859 1996 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 ZNF331-201ENST00000253144 5042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 CU639417.6-202ENST00000624872 3241 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 KIAA1324-210ENST00000529753 2903 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 CTNNB1-202ENST00000396183 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 EPB41L1-206ENST00000373950 3631 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 SEC31A-208ENST00000448323 4255 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 MAK16-201ENST00000360128 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 CCNY-203ENST00000374704 3960 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 HYLS1-202ENST00000425380 2061 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 FAM102A-202ENST00000373084 3352 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 STXBP6-202ENST00000396700 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 RRBP1-202ENST00000360807 3727 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 AEBP1-201ENST00000223357 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 KIF25-AS1-202ENST00000456585 2795 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 AL031687.1-201ENST00000450586 2137 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 C9orf106-201ENST00000316786 3145 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 LANCL1-205ENST00000443314 4781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 SRPK3-208ENST00000489426 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 DNM1-213ENST00000628346 3835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 PYGM-201ENST00000164139 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 GAS7-219ENST00000585266 3535 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 TRPM2-203ENST00000397928 6221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 RNFT2-201ENST00000257575 3882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 CAD-202ENST00000403525 6900 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 LIMS1-205ENST00000410093 1526 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 GLIPR2-202ENST00000377960 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 PSG8-AS1-201ENST00000425668 1873 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 PACSIN1-207ENST00000620693 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 SLC4A1-201ENST00000262418 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 IL12RB1-207ENST00000600835 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 SYK-204ENST00000375754 5005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 SAP18-201ENST00000382533 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 ZNF573-204ENST00000392138 2266 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 GAS8-220ENST00000620723 3308 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 CFAP65-208ENST00000453220 5877 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms