Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 AC025594.2-201ENST00000609480 3902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 GSE1-202ENST00000393243 7140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 LMBRD2-201ENST00000296603 8185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 PROM2-201ENST00000317620 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 AC104129.1-202ENST00000480694 4481 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 AFF3-201ENST00000317233 8135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 ABCB8-202ENST00000358849 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 MPLKIP-201ENST00000306984 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 MGRN1-203ENST00000415496 6405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 TOM1L2-214ENST00000581396 5595 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 AFF1-201ENST00000307808 9390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 CHD5-201ENST00000262450 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 LDB3-202ENST00000361373 5297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 NFKB1-201ENST00000226574 4085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 EPHB1-201ENST00000398015 4672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 AC125611.4-201ENST00000553259 4166 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 FLNA-201ENST00000344736 7932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms