Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms