Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 MTA3-202ENST00000405592 5832 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 UNC5CL-201ENST00000244565 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 SOAT1-204ENST00000540564 6861 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 AP002761.4-201ENST00000565433 3361 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 USP49-201ENST00000373006 3177 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 OS9-201ENST00000257966 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 MEST-204ENST00000393187 2380 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 TIPARP-201ENST00000295924 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 MEG3-213ENST00000455531 4867 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 ZNF721-205ENST00000511833 2966 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 SLC25A26-202ENST00000354883 2673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 KLHL8-201ENST00000273963 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 PI4KB-203ENST00000368874 3934 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 ZNF341-202ENST00000375200 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 CRY2-202ENST00000443527 4203 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms