Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB65

ELL3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3Q9HB65 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ELL3Q9HB65 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ELL3Q9HB65 ST8SIA1-203ENST00000396037 9714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ELL3Q9HB65 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ELL3Q9HB65 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ELL3Q9HB65 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ELL3Q9HB65 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ELL3Q9HB65 GRIN1-204ENST00000371553 3751 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ELL3Q9HB65 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ELL3Q9HB65 RNF43-201ENST00000407977 5516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ELL3Q9HB65 PRKCE-201ENST00000306156 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ELL3Q9HB65 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ELL3Q9HB65 ARID4A-202ENST00000355431 5891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ELL3Q9HB65 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ELL3Q9HB65 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ELL3Q9HB65 SEMA6D-202ENST00000354744 5931 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ELL3Q9HB65 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ELL3Q9HB65 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ELL3Q9HB65 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ELL3Q9HB65 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ELL3Q9HB65 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ELL3Q9HB65 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ELL3Q9HB65 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
ELL3Q9HB65 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ELL3Q9HB65 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ELL3Q9HB65 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ELL3Q9HB65 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ELL3Q9HB65 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ELL3Q9HB65 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
ELL3Q9HB65 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ELL3Q9HB65 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ELL3Q9HB65 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ELL3Q9HB65 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ELL3Q9HB65 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ELL3Q9HB65 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
ELL3Q9HB65 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ELL3Q9HB65 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ELL3Q9HB65 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ELL3Q9HB65 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ELL3Q9HB65 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ELL3Q9HB65 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ELL3Q9HB65 NAA15-202ENST00000398947 6072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ELL3Q9HB65 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ELL3Q9HB65 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ELL3Q9HB65 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
ELL3Q9HB65 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ELL3Q9HB65 SPATA13-203ENST00000382108 8463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ELL3Q9HB65 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ELL3Q9HB65 FOXK1-201ENST00000328914 11181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ELL3Q9HB65 BCAS4-202ENST00000371608 6680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ELL3Q9HB65 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ELL3Q9HB65 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ELL3Q9HB65 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ELL3Q9HB65 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ELL3Q9HB65 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ELL3Q9HB65 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ELL3Q9HB65 TMEM131L-203ENST00000409959 5017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ELL3Q9HB65 SMC4-202ENST00000357388 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ELL3Q9HB65 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ELL3Q9HB65 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ELL3Q9HB65 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ELL3Q9HB65 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ELL3Q9HB65 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ELL3Q9HB65 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ELL3Q9HB65 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ELL3Q9HB65 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ELL3Q9HB65 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ELL3Q9HB65 ANKRD30B-202ENST00000358984 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ELL3Q9HB65 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ELL3Q9HB65 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ELL3Q9HB65 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ELL3Q9HB65 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ELL3Q9HB65 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ELL3Q9HB65 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ELL3Q9HB65 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ELL3Q9HB65 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
ELL3Q9HB65 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
ELL3Q9HB65 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ELL3Q9HB65 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ELL3Q9HB65 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
ELL3Q9HB65 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ELL3Q9HB65 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ELL3Q9HB65 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
ELL3Q9HB65 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
ELL3Q9HB65 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ELL3Q9HB65 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ELL3Q9HB65 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ELL3Q9HB65 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ELL3Q9HB65 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ELL3Q9HB65 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
ELL3Q9HB65 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
ELL3Q9HB65 ARAP1-204ENST00000393609 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ELL3Q9HB65 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ELL3Q9HB65 PERP-201ENST00000421351 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ELL3Q9HB65 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ELL3Q9HB65 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ELL3Q9HB65 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ELL3Q9HB65 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ELL3Q9HB65 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ELL3Q9HB65 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms