Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCSER1Q9C0I3 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCSER1Q9C0I3 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCSER1Q9C0I3 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCSER1Q9C0I3 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCSER1Q9C0I3 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCSER1Q9C0I3 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCSER1Q9C0I3 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCSER1Q9C0I3 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCSER1Q9C0I3 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCSER1Q9C0I3 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCSER1Q9C0I3 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CCSER1Q9C0I3 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CCSER1Q9C0I3 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCSER1Q9C0I3 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CCSER1Q9C0I3 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCSER1Q9C0I3 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCSER1Q9C0I3 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCSER1Q9C0I3 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCSER1Q9C0I3 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCSER1Q9C0I3 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CCSER1Q9C0I3 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCSER1Q9C0I3 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCSER1Q9C0I3 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCSER1Q9C0I3 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCSER1Q9C0I3 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCSER1Q9C0I3 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CCSER1Q9C0I3 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CCSER1Q9C0I3 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCSER1Q9C0I3 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CCSER1Q9C0I3 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CCSER1Q9C0I3 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCSER1Q9C0I3 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCSER1Q9C0I3 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCSER1Q9C0I3 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCSER1Q9C0I3 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCSER1Q9C0I3 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCSER1Q9C0I3 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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