Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 CAMKV-215ENST00000488336 2905 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCGF6Q9BYE7 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCGF6Q9BYE7 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCGF6Q9BYE7 SUPT7L-203ENST00000405491 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCGF6Q9BYE7 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCGF6Q9BYE7 HINT3-201ENST00000229633 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCGF6Q9BYE7 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCGF6Q9BYE7 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCGF6Q9BYE7 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCGF6Q9BYE7 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCGF6Q9BYE7 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCGF6Q9BYE7 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCGF6Q9BYE7 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PCGF6Q9BYE7 RUFY4-201ENST00000344321 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCGF6Q9BYE7 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCGF6Q9BYE7 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PCGF6Q9BYE7 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCGF6Q9BYE7 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCGF6Q9BYE7 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCGF6Q9BYE7 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PCGF6Q9BYE7 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCGF6Q9BYE7 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCGF6Q9BYE7 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCGF6Q9BYE7 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PCGF6Q9BYE7 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCGF6Q9BYE7 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCGF6Q9BYE7 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCGF6Q9BYE7 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PCGF6Q9BYE7 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCGF6Q9BYE7 TESMIN-204ENST00000443940 3495 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCGF6Q9BYE7 PBXIP1-203ENST00000368465 3144 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCGF6Q9BYE7 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCGF6Q9BYE7 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCGF6Q9BYE7 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCGF6Q9BYE7 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCGF6Q9BYE7 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCGF6Q9BYE7 SLC35F2-203ENST00000525071 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCGF6Q9BYE7 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCGF6Q9BYE7 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCGF6Q9BYE7 AP001999.1-201ENST00000513405 3684 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCGF6Q9BYE7 KAZN-205ENST00000400798 3643 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCGF6Q9BYE7 AC125611.4-201ENST00000553259 4166 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCGF6Q9BYE7 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCGF6Q9BYE7 PLPP6-201ENST00000381883 2944 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCGF6Q9BYE7 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCGF6Q9BYE7 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCGF6Q9BYE7 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCGF6Q9BYE7 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCGF6Q9BYE7 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCGF6Q9BYE7 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCGF6Q9BYE7 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCGF6Q9BYE7 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCGF6Q9BYE7 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PCGF6Q9BYE7 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCGF6Q9BYE7 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCGF6Q9BYE7 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PCGF6Q9BYE7 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCGF6Q9BYE7 AAR2-202ENST00000373932 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCGF6Q9BYE7 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCGF6Q9BYE7 BIRC2-208ENST00000532672 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCGF6Q9BYE7 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PCGF6Q9BYE7 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCGF6Q9BYE7 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCGF6Q9BYE7 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCGF6Q9BYE7 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCGF6Q9BYE7 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCGF6Q9BYE7 SLC1A1-201ENST00000262352 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCGF6Q9BYE7 TMEM41A-203ENST00000421852 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCGF6Q9BYE7 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCGF6Q9BYE7 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCGF6Q9BYE7 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCGF6Q9BYE7 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCGF6Q9BYE7 TRIM4-201ENST00000349062 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCGF6Q9BYE7 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCGF6Q9BYE7 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCGF6Q9BYE7 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCGF6Q9BYE7 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCGF6Q9BYE7 CNN2-202ENST00000348419 2033 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCGF6Q9BYE7 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCGF6Q9BYE7 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCGF6Q9BYE7 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCGF6Q9BYE7 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCGF6Q9BYE7 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCGF6Q9BYE7 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PCGF6Q9BYE7 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCGF6Q9BYE7 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCGF6Q9BYE7 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PCGF6Q9BYE7 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PCGF6Q9BYE7 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCGF6Q9BYE7 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCGF6Q9BYE7 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCGF6Q9BYE7 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PCGF6Q9BYE7 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PCGF6Q9BYE7 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCGF6Q9BYE7 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PCGF6Q9BYE7 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCGF6Q9BYE7 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCGF6Q9BYE7 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCGF6Q9BYE7 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCGF6Q9BYE7 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms