Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms