Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ31

KCNS3, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 3, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS3Q9BQ31 FURIN-206ENST00000610579 4191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 RSBN1L-201ENST00000334955 6422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 CD276-202ENST00000318443 3469 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 CAD-202ENST00000403525 6900 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 AC125611.4-201ENST00000553259 4166 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 DAAM2-202ENST00000398904 6224 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 BEGAIN-212ENST00000637716 3259 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms