Protein–RNA interactions for Protein: Q99542

MMP19, Matrix metalloproteinase-19, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP19Q99542 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MMP19Q99542 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MMP19Q99542 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MMP19Q99542 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MMP19Q99542 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MMP19Q99542 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MMP19Q99542 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MMP19Q99542 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MMP19Q99542 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MMP19Q99542 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MMP19Q99542 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MMP19Q99542 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MMP19Q99542 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MMP19Q99542 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MMP19Q99542 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MMP19Q99542 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MMP19Q99542 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MMP19Q99542 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MMP19Q99542 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MMP19Q99542 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MMP19Q99542 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MMP19Q99542 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MMP19Q99542 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MMP19Q99542 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MMP19Q99542 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MMP19Q99542 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MMP19Q99542 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MMP19Q99542 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MMP19Q99542 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MMP19Q99542 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MMP19Q99542 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MMP19Q99542 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MMP19Q99542 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MMP19Q99542 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MMP19Q99542 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MMP19Q99542 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MMP19Q99542 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MMP19Q99542 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MMP19Q99542 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MMP19Q99542 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MMP19Q99542 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MMP19Q99542 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MMP19Q99542 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MMP19Q99542 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MMP19Q99542 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MMP19Q99542 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MMP19Q99542 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MMP19Q99542 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MMP19Q99542 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MMP19Q99542 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MMP19Q99542 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MMP19Q99542 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MMP19Q99542 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MMP19Q99542 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MMP19Q99542 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MMP19Q99542 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MMP19Q99542 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MMP19Q99542 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MMP19Q99542 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MMP19Q99542 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MMP19Q99542 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MMP19Q99542 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MMP19Q99542 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MMP19Q99542 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MMP19Q99542 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MMP19Q99542 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MMP19Q99542 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MMP19Q99542 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MMP19Q99542 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MMP19Q99542 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MMP19Q99542 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MMP19Q99542 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MMP19Q99542 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MMP19Q99542 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MMP19Q99542 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MMP19Q99542 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MMP19Q99542 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MMP19Q99542 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MMP19Q99542 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MMP19Q99542 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MMP19Q99542 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MMP19Q99542 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MMP19Q99542 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MMP19Q99542 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MMP19Q99542 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MMP19Q99542 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MMP19Q99542 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MMP19Q99542 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MMP19Q99542 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MMP19Q99542 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MMP19Q99542 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MMP19Q99542 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MMP19Q99542 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MMP19Q99542 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MMP19Q99542 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MMP19Q99542 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MMP19Q99542 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MMP19Q99542 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MMP19Q99542 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MMP19Q99542 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.7 ms