Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
SIN3AQ96ST3 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
SIN3AQ96ST3 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SIN3AQ96ST3 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SIN3AQ96ST3 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SIN3AQ96ST3 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SIN3AQ96ST3 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SIN3AQ96ST3 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SIN3AQ96ST3 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SIN3AQ96ST3 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SIN3AQ96ST3 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SIN3AQ96ST3 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SIN3AQ96ST3 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SIN3AQ96ST3 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SIN3AQ96ST3 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SIN3AQ96ST3 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SIN3AQ96ST3 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SIN3AQ96ST3 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SIN3AQ96ST3 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SIN3AQ96ST3 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SIN3AQ96ST3 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SIN3AQ96ST3 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SIN3AQ96ST3 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SIN3AQ96ST3 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SIN3AQ96ST3 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SIN3AQ96ST3 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SIN3AQ96ST3 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SIN3AQ96ST3 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SIN3AQ96ST3 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SIN3AQ96ST3 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SIN3AQ96ST3 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SIN3AQ96ST3 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SIN3AQ96ST3 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SIN3AQ96ST3 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SIN3AQ96ST3 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SIN3AQ96ST3 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SIN3AQ96ST3 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SIN3AQ96ST3 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SIN3AQ96ST3 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SIN3AQ96ST3 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SIN3AQ96ST3 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SIN3AQ96ST3 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SIN3AQ96ST3 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SIN3AQ96ST3 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SIN3AQ96ST3 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SIN3AQ96ST3 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SIN3AQ96ST3 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SIN3AQ96ST3 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SIN3AQ96ST3 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SIN3AQ96ST3 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SIN3AQ96ST3 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SIN3AQ96ST3 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SIN3AQ96ST3 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SIN3AQ96ST3 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SIN3AQ96ST3 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
SIN3AQ96ST3 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SIN3AQ96ST3 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SIN3AQ96ST3 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SIN3AQ96ST3 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SIN3AQ96ST3 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SIN3AQ96ST3 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
SIN3AQ96ST3 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SIN3AQ96ST3 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SIN3AQ96ST3 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SIN3AQ96ST3 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
SIN3AQ96ST3 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SIN3AQ96ST3 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
SIN3AQ96ST3 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SIN3AQ96ST3 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SIN3AQ96ST3 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SIN3AQ96ST3 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
SIN3AQ96ST3 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SIN3AQ96ST3 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SIN3AQ96ST3 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SIN3AQ96ST3 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SIN3AQ96ST3 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SIN3AQ96ST3 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SIN3AQ96ST3 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SIN3AQ96ST3 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SIN3AQ96ST3 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms