Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
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GTF3C6Q969F1 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF3C6Q969F1 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF3C6Q969F1 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF3C6Q969F1 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF3C6Q969F1 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF3C6Q969F1 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
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GTF3C6Q969F1 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
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GTF3C6Q969F1 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
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GTF3C6Q969F1 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
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GTF3C6Q969F1 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
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GTF3C6Q969F1 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
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GTF3C6Q969F1 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF3C6Q969F1 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF3C6Q969F1 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF3C6Q969F1 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
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GTF3C6Q969F1 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF3C6Q969F1 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
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GTF3C6Q969F1 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
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GTF3C6Q969F1 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF3C6Q969F1 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF3C6Q969F1 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF3C6Q969F1 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF3C6Q969F1 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF3C6Q969F1 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF3C6Q969F1 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF3C6Q969F1 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF3C6Q969F1 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF3C6Q969F1 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF3C6Q969F1 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF3C6Q969F1 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF3C6Q969F1 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF3C6Q969F1 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF3C6Q969F1 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF3C6Q969F1 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.9 ms