Protein–RNA interactions for Protein: Q92995

USP13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 863 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13Q92995 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP13Q92995 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP13Q92995 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP13Q92995 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
USP13Q92995 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP13Q92995 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP13Q92995 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP13Q92995 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP13Q92995 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP13Q92995 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP13Q92995 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
USP13Q92995 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
USP13Q92995 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP13Q92995 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP13Q92995 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP13Q92995 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP13Q92995 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP13Q92995 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP13Q92995 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP13Q92995 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
USP13Q92995 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP13Q92995 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP13Q92995 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP13Q92995 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP13Q92995 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
USP13Q92995 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP13Q92995 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP13Q92995 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP13Q92995 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP13Q92995 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP13Q92995 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP13Q92995 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP13Q92995 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP13Q92995 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
USP13Q92995 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
USP13Q92995 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
USP13Q92995 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
USP13Q92995 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
USP13Q92995 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
USP13Q92995 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
USP13Q92995 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP13Q92995 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP13Q92995 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP13Q92995 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP13Q92995 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP13Q92995 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP13Q92995 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP13Q92995 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP13Q92995 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP13Q92995 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP13Q92995 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP13Q92995 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP13Q92995 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP13Q92995 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP13Q92995 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP13Q92995 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP13Q92995 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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USP13Q92995 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
USP13Q92995 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
USP13Q92995 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP13Q92995 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
USP13Q92995 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP13Q92995 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP13Q92995 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP13Q92995 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP13Q92995 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP13Q92995 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP13Q92995 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP13Q92995 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP13Q92995 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP13Q92995 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP13Q92995 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP13Q92995 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP13Q92995 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP13Q92995 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP13Q92995 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP13Q92995 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP13Q92995 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP13Q92995 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP13Q92995 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP13Q92995 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP13Q92995 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP13Q92995 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP13Q92995 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP13Q92995 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP13Q92995 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP13Q92995 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP13Q92995 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP13Q92995 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP13Q92995 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP13Q92995 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP13Q92995 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP13Q92995 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP13Q92995 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP13Q92995 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP13Q92995 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP13Q92995 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP13Q92995 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
USP13Q92995 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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