Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 HNF1B-204ENST00000617811 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 STRA6-202ENST00000395105 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 TOE1-201ENST00000372090 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 TOMM40L-209ENST00000545897 2807 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 CPT1C-202ENST00000323446 2783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms