Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXI1

RHOT2, Mitochondrial Rho GTPase 2, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOT2Q8IXI1 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOT2Q8IXI1 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOT2Q8IXI1 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOT2Q8IXI1 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOT2Q8IXI1 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOT2Q8IXI1 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOT2Q8IXI1 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOT2Q8IXI1 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOT2Q8IXI1 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOT2Q8IXI1 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOT2Q8IXI1 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOT2Q8IXI1 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOT2Q8IXI1 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOT2Q8IXI1 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOT2Q8IXI1 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOT2Q8IXI1 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOT2Q8IXI1 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOT2Q8IXI1 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOT2Q8IXI1 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOT2Q8IXI1 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOT2Q8IXI1 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOT2Q8IXI1 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOT2Q8IXI1 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOT2Q8IXI1 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOT2Q8IXI1 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOT2Q8IXI1 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOT2Q8IXI1 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOT2Q8IXI1 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOT2Q8IXI1 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOT2Q8IXI1 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOT2Q8IXI1 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOT2Q8IXI1 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOT2Q8IXI1 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOT2Q8IXI1 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOT2Q8IXI1 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOT2Q8IXI1 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOT2Q8IXI1 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOT2Q8IXI1 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOT2Q8IXI1 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOT2Q8IXI1 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOT2Q8IXI1 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOT2Q8IXI1 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOT2Q8IXI1 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOT2Q8IXI1 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOT2Q8IXI1 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOT2Q8IXI1 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOT2Q8IXI1 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOT2Q8IXI1 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOT2Q8IXI1 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOT2Q8IXI1 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOT2Q8IXI1 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOT2Q8IXI1 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOT2Q8IXI1 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOT2Q8IXI1 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOT2Q8IXI1 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOT2Q8IXI1 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOT2Q8IXI1 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOT2Q8IXI1 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOT2Q8IXI1 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOT2Q8IXI1 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOT2Q8IXI1 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOT2Q8IXI1 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOT2Q8IXI1 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOT2Q8IXI1 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOT2Q8IXI1 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOT2Q8IXI1 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOT2Q8IXI1 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOT2Q8IXI1 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOT2Q8IXI1 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOT2Q8IXI1 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOT2Q8IXI1 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOT2Q8IXI1 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOT2Q8IXI1 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOT2Q8IXI1 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOT2Q8IXI1 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOT2Q8IXI1 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOT2Q8IXI1 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOT2Q8IXI1 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOT2Q8IXI1 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOT2Q8IXI1 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOT2Q8IXI1 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOT2Q8IXI1 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOT2Q8IXI1 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOT2Q8IXI1 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOT2Q8IXI1 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOT2Q8IXI1 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOT2Q8IXI1 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOT2Q8IXI1 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOT2Q8IXI1 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOT2Q8IXI1 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOT2Q8IXI1 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOT2Q8IXI1 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOT2Q8IXI1 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOT2Q8IXI1 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOT2Q8IXI1 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOT2Q8IXI1 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOT2Q8IXI1 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOT2Q8IXI1 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOT2Q8IXI1 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOT2Q8IXI1 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms