Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 COL6A3-202ENST00000347401 8625 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATG16L1Q676U5 COL6A3-209ENST00000472056 8628 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATG16L1Q676U5 DNMT3B-202ENST00000328111 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATG16L1Q676U5 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATG16L1Q676U5 CHRFAM7A-201ENST00000299847 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATG16L1Q676U5 MAP3K4-203ENST00000366920 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATG16L1Q676U5 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATG16L1Q676U5 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATG16L1Q676U5 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATG16L1Q676U5 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATG16L1Q676U5 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATG16L1Q676U5 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATG16L1Q676U5 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATG16L1Q676U5 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATG16L1Q676U5 KDM5C-208ENST00000452825 6096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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ATG16L1Q676U5 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATG16L1Q676U5 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATG16L1Q676U5 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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ATG16L1Q676U5 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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ATG16L1Q676U5 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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ATG16L1Q676U5 GRWD1-201ENST00000253237 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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ATG16L1Q676U5 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
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ATG16L1Q676U5 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
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