Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 OR6S1-201ENST00000320704 996 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 NAV2-AS2-201ENST00000533767 782 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 AC010202.1-201ENST00000551181 405 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 AC011483.3-201ENST00000601506 826 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 AC021321.1-201ENST00000607397 1113 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 AC139100.2-201ENST00000616901 662 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 DAO-208ENST00000551281 1345 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 NAAA-203ENST00000505594 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 LGALS4-201ENST00000307751 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 TMSB4X-202ENST00000380635 767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 AL357033.2-201ENST00000430184 739 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 TCEAL4-206ENST00000468024 1135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 RNA5SP288-201ENST00000516075 93 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 TBX5-AS1-202ENST00000531024 766 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 SCAMP5-216ENST00000568081 710 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 ACTBP9-201ENST00000587663 1099 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 PAX6-237ENST00000638696 1203 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 PPARG-205ENST00000397010 2017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 AL121753.2-201ENST00000624581 1461 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 PMM1-201ENST00000216259 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 FTHL17-201ENST00000359202 813 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 FUNDC1-201ENST00000378045 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 CHEK2-203ENST00000382565 696 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 THAP4-203ENST00000402545 833 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 AL513165.1-201ENST00000413915 289 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 ZNF816-208ENST00000535506 529 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 AC022098.2-201ENST00000590528 518 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 SNX20-205ENST00000610485 557 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 OR3A1-202ENST00000615105 966 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 SRP19-208ENST00000621420 1270 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 LYPLA1-202ENST00000343231 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 TTN-AS1-264ENST00000627564 1319 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 BPIFB6-201ENST00000349552 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 LINC00682-202ENST00000499082 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 WFDC2-203ENST00000342873 818 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 VKORC1-203ENST00000354895 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 SPATA21-202ENST00000375577 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 CYP4F29P-202ENST00000428301 1279 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 BX322557.2-201ENST00000445242 379 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 PRSS55-203ENST00000522210 1005 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 OR4A49P-201ENST00000527050 632 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 AP000439.2-201ENST00000542064 726 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 CDC37P2-201ENST00000562287 1029 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 AC008982.2-201ENST00000600473 493 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 NR1I2-206ENST00000638727 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 INCA1-201ENST00000355025 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms