Protein–RNA interactions for Protein: Q5GLZ8

HERC4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4Q5GLZ8 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERC4Q5GLZ8 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERC4Q5GLZ8 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERC4Q5GLZ8 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERC4Q5GLZ8 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HERC4Q5GLZ8 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERC4Q5GLZ8 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERC4Q5GLZ8 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERC4Q5GLZ8 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERC4Q5GLZ8 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERC4Q5GLZ8 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERC4Q5GLZ8 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERC4Q5GLZ8 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERC4Q5GLZ8 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERC4Q5GLZ8 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERC4Q5GLZ8 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERC4Q5GLZ8 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERC4Q5GLZ8 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERC4Q5GLZ8 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERC4Q5GLZ8 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERC4Q5GLZ8 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERC4Q5GLZ8 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERC4Q5GLZ8 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERC4Q5GLZ8 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERC4Q5GLZ8 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERC4Q5GLZ8 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERC4Q5GLZ8 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERC4Q5GLZ8 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERC4Q5GLZ8 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERC4Q5GLZ8 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERC4Q5GLZ8 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERC4Q5GLZ8 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERC4Q5GLZ8 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERC4Q5GLZ8 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERC4Q5GLZ8 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERC4Q5GLZ8 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERC4Q5GLZ8 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HERC4Q5GLZ8 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERC4Q5GLZ8 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERC4Q5GLZ8 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HERC4Q5GLZ8 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERC4Q5GLZ8 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HERC4Q5GLZ8 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERC4Q5GLZ8 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERC4Q5GLZ8 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERC4Q5GLZ8 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERC4Q5GLZ8 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERC4Q5GLZ8 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERC4Q5GLZ8 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERC4Q5GLZ8 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HERC4Q5GLZ8 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERC4Q5GLZ8 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERC4Q5GLZ8 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERC4Q5GLZ8 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERC4Q5GLZ8 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERC4Q5GLZ8 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERC4Q5GLZ8 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERC4Q5GLZ8 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERC4Q5GLZ8 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERC4Q5GLZ8 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERC4Q5GLZ8 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERC4Q5GLZ8 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERC4Q5GLZ8 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERC4Q5GLZ8 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERC4Q5GLZ8 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERC4Q5GLZ8 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERC4Q5GLZ8 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERC4Q5GLZ8 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERC4Q5GLZ8 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HERC4Q5GLZ8 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERC4Q5GLZ8 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERC4Q5GLZ8 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HERC4Q5GLZ8 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERC4Q5GLZ8 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERC4Q5GLZ8 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERC4Q5GLZ8 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERC4Q5GLZ8 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERC4Q5GLZ8 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERC4Q5GLZ8 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERC4Q5GLZ8 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERC4Q5GLZ8 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERC4Q5GLZ8 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERC4Q5GLZ8 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERC4Q5GLZ8 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HERC4Q5GLZ8 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERC4Q5GLZ8 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERC4Q5GLZ8 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERC4Q5GLZ8 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERC4Q5GLZ8 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERC4Q5GLZ8 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERC4Q5GLZ8 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERC4Q5GLZ8 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERC4Q5GLZ8 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERC4Q5GLZ8 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERC4Q5GLZ8 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERC4Q5GLZ8 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERC4Q5GLZ8 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERC4Q5GLZ8 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERC4Q5GLZ8 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERC4Q5GLZ8 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms