Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y0

SLC39A12, Zinc transporter ZIP12, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A12Q504Y0 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC39A12Q504Y0 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC39A12Q504Y0 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC39A12Q504Y0 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC39A12Q504Y0 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC39A12Q504Y0 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC39A12Q504Y0 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC39A12Q504Y0 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC39A12Q504Y0 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC39A12Q504Y0 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC39A12Q504Y0 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC39A12Q504Y0 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC39A12Q504Y0 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC39A12Q504Y0 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC39A12Q504Y0 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC39A12Q504Y0 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC39A12Q504Y0 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC39A12Q504Y0 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC39A12Q504Y0 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC39A12Q504Y0 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC39A12Q504Y0 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC39A12Q504Y0 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC39A12Q504Y0 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC39A12Q504Y0 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC39A12Q504Y0 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC39A12Q504Y0 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC39A12Q504Y0 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC39A12Q504Y0 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC39A12Q504Y0 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC39A12Q504Y0 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC39A12Q504Y0 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC39A12Q504Y0 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC39A12Q504Y0 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC39A12Q504Y0 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC39A12Q504Y0 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC39A12Q504Y0 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC39A12Q504Y0 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC39A12Q504Y0 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC39A12Q504Y0 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC39A12Q504Y0 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC39A12Q504Y0 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC39A12Q504Y0 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC39A12Q504Y0 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC39A12Q504Y0 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC39A12Q504Y0 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC39A12Q504Y0 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC39A12Q504Y0 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC39A12Q504Y0 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC39A12Q504Y0 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC39A12Q504Y0 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC39A12Q504Y0 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC39A12Q504Y0 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC39A12Q504Y0 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC39A12Q504Y0 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC39A12Q504Y0 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC39A12Q504Y0 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC39A12Q504Y0 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC39A12Q504Y0 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC39A12Q504Y0 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC39A12Q504Y0 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC39A12Q504Y0 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC39A12Q504Y0 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC39A12Q504Y0 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC39A12Q504Y0 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC39A12Q504Y0 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC39A12Q504Y0 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC39A12Q504Y0 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC39A12Q504Y0 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC39A12Q504Y0 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC39A12Q504Y0 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC39A12Q504Y0 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC39A12Q504Y0 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC39A12Q504Y0 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC39A12Q504Y0 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC39A12Q504Y0 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC39A12Q504Y0 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC39A12Q504Y0 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC39A12Q504Y0 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC39A12Q504Y0 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC39A12Q504Y0 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC39A12Q504Y0 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC39A12Q504Y0 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC39A12Q504Y0 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC39A12Q504Y0 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC39A12Q504Y0 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC39A12Q504Y0 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC39A12Q504Y0 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC39A12Q504Y0 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC39A12Q504Y0 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC39A12Q504Y0 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC39A12Q504Y0 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC39A12Q504Y0 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC39A12Q504Y0 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC39A12Q504Y0 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC39A12Q504Y0 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC39A12Q504Y0 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC39A12Q504Y0 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC39A12Q504Y0 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC39A12Q504Y0 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC39A12Q504Y0 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms