Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYB3

FOXD4L6, Forkhead box protein D4-like 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L6Q3SYB3 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXD4L6Q3SYB3 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXD4L6Q3SYB3 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXD4L6Q3SYB3 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXD4L6Q3SYB3 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXD4L6Q3SYB3 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXD4L6Q3SYB3 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXD4L6Q3SYB3 GSE1-203ENST00000405402 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXD4L6Q3SYB3 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXD4L6Q3SYB3 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXD4L6Q3SYB3 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXD4L6Q3SYB3 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXD4L6Q3SYB3 HPS1-215ENST00000613394 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXD4L6Q3SYB3 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXD4L6Q3SYB3 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXD4L6Q3SYB3 PI4KB-203ENST00000368874 3934 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXD4L6Q3SYB3 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXD4L6Q3SYB3 TNN-202ENST00000621086 4234 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXD4L6Q3SYB3 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXD4L6Q3SYB3 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXD4L6Q3SYB3 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXD4L6Q3SYB3 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXD4L6Q3SYB3 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXD4L6Q3SYB3 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXD4L6Q3SYB3 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXD4L6Q3SYB3 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXD4L6Q3SYB3 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXD4L6Q3SYB3 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXD4L6Q3SYB3 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXD4L6Q3SYB3 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXD4L6Q3SYB3 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXD4L6Q3SYB3 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXD4L6Q3SYB3 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXD4L6Q3SYB3 SGMS1-202ENST00000361781 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXD4L6Q3SYB3 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXD4L6Q3SYB3 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXD4L6Q3SYB3 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXD4L6Q3SYB3 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXD4L6Q3SYB3 SEMA3F-201ENST00000002829 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXD4L6Q3SYB3 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXD4L6Q3SYB3 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXD4L6Q3SYB3 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXD4L6Q3SYB3 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXD4L6Q3SYB3 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXD4L6Q3SYB3 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXD4L6Q3SYB3 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXD4L6Q3SYB3 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXD4L6Q3SYB3 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXD4L6Q3SYB3 PWWP2A-202ENST00000456329 3991 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXD4L6Q3SYB3 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXD4L6Q3SYB3 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXD4L6Q3SYB3 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXD4L6Q3SYB3 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXD4L6Q3SYB3 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXD4L6Q3SYB3 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXD4L6Q3SYB3 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXD4L6Q3SYB3 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXD4L6Q3SYB3 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXD4L6Q3SYB3 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXD4L6Q3SYB3 EBF3-201ENST00000355311 2993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXD4L6Q3SYB3 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXD4L6Q3SYB3 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXD4L6Q3SYB3 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXD4L6Q3SYB3 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXD4L6Q3SYB3 FOXM1-210ENST00000627656 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXD4L6Q3SYB3 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXD4L6Q3SYB3 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXD4L6Q3SYB3 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXD4L6Q3SYB3 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXD4L6Q3SYB3 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXD4L6Q3SYB3 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXD4L6Q3SYB3 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXD4L6Q3SYB3 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXD4L6Q3SYB3 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXD4L6Q3SYB3 ADAMTSL4-201ENST00000271643 4250 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXD4L6Q3SYB3 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXD4L6Q3SYB3 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXD4L6Q3SYB3 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXD4L6Q3SYB3 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXD4L6Q3SYB3 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXD4L6Q3SYB3 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXD4L6Q3SYB3 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXD4L6Q3SYB3 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXD4L6Q3SYB3 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXD4L6Q3SYB3 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXD4L6Q3SYB3 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXD4L6Q3SYB3 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXD4L6Q3SYB3 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXD4L6Q3SYB3 SLC5A5-201ENST00000222248 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXD4L6Q3SYB3 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXD4L6Q3SYB3 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXD4L6Q3SYB3 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXD4L6Q3SYB3 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXD4L6Q3SYB3 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXD4L6Q3SYB3 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXD4L6Q3SYB3 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXD4L6Q3SYB3 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXD4L6Q3SYB3 MMP14-201ENST00000311852 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXD4L6Q3SYB3 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXD4L6Q3SYB3 SUN2-201ENST00000405018 4022 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms