Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TWISTNBQ3B726 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TWISTNBQ3B726 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TWISTNBQ3B726 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TWISTNBQ3B726 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TWISTNBQ3B726 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TWISTNBQ3B726 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TWISTNBQ3B726 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TWISTNBQ3B726 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TWISTNBQ3B726 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TWISTNBQ3B726 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
TWISTNBQ3B726 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TWISTNBQ3B726 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TWISTNBQ3B726 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TWISTNBQ3B726 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TWISTNBQ3B726 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
TWISTNBQ3B726 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
TWISTNBQ3B726 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TWISTNBQ3B726 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TWISTNBQ3B726 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TWISTNBQ3B726 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
TWISTNBQ3B726 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TWISTNBQ3B726 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TWISTNBQ3B726 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TWISTNBQ3B726 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TWISTNBQ3B726 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TWISTNBQ3B726 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TWISTNBQ3B726 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TWISTNBQ3B726 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TWISTNBQ3B726 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TWISTNBQ3B726 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
TWISTNBQ3B726 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
TWISTNBQ3B726 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TWISTNBQ3B726 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
TWISTNBQ3B726 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
TWISTNBQ3B726 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TWISTNBQ3B726 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TWISTNBQ3B726 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TWISTNBQ3B726 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TWISTNBQ3B726 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TWISTNBQ3B726 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TWISTNBQ3B726 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TWISTNBQ3B726 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TWISTNBQ3B726 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TWISTNBQ3B726 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TWISTNBQ3B726 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TWISTNBQ3B726 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TWISTNBQ3B726 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TWISTNBQ3B726 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TWISTNBQ3B726 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TWISTNBQ3B726 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TWISTNBQ3B726 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TWISTNBQ3B726 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TWISTNBQ3B726 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TWISTNBQ3B726 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TWISTNBQ3B726 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TWISTNBQ3B726 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TWISTNBQ3B726 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TWISTNBQ3B726 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TWISTNBQ3B726 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TWISTNBQ3B726 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TWISTNBQ3B726 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TWISTNBQ3B726 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TWISTNBQ3B726 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TWISTNBQ3B726 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TWISTNBQ3B726 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TWISTNBQ3B726 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TWISTNBQ3B726 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TWISTNBQ3B726 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TWISTNBQ3B726 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TWISTNBQ3B726 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TWISTNBQ3B726 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TWISTNBQ3B726 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TWISTNBQ3B726 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TWISTNBQ3B726 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TWISTNBQ3B726 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TWISTNBQ3B726 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TWISTNBQ3B726 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TWISTNBQ3B726 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TWISTNBQ3B726 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TWISTNBQ3B726 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TWISTNBQ3B726 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TWISTNBQ3B726 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TWISTNBQ3B726 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TWISTNBQ3B726 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TWISTNBQ3B726 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TWISTNBQ3B726 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TWISTNBQ3B726 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TWISTNBQ3B726 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TWISTNBQ3B726 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TWISTNBQ3B726 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TWISTNBQ3B726 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TWISTNBQ3B726 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TWISTNBQ3B726 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TWISTNBQ3B726 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TWISTNBQ3B726 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TWISTNBQ3B726 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TWISTNBQ3B726 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TWISTNBQ3B726 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TWISTNBQ3B726 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms