Protein–RNA interactions for Protein: Q16543

CDC37, Hsp90 co-chaperone Cdc37, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 378 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC37Q16543 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDC37Q16543 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDC37Q16543 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CDC37Q16543 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDC37Q16543 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDC37Q16543 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDC37Q16543 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDC37Q16543 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDC37Q16543 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDC37Q16543 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDC37Q16543 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDC37Q16543 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDC37Q16543 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDC37Q16543 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDC37Q16543 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDC37Q16543 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDC37Q16543 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDC37Q16543 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDC37Q16543 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDC37Q16543 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDC37Q16543 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDC37Q16543 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDC37Q16543 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CDC37Q16543 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CDC37Q16543 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDC37Q16543 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDC37Q16543 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDC37Q16543 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDC37Q16543 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDC37Q16543 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDC37Q16543 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDC37Q16543 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDC37Q16543 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDC37Q16543 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDC37Q16543 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDC37Q16543 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDC37Q16543 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDC37Q16543 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDC37Q16543 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDC37Q16543 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CDC37Q16543 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CDC37Q16543 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDC37Q16543 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CDC37Q16543 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDC37Q16543 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CDC37Q16543 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDC37Q16543 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CDC37Q16543 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CDC37Q16543 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDC37Q16543 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDC37Q16543 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDC37Q16543 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDC37Q16543 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDC37Q16543 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDC37Q16543 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDC37Q16543 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDC37Q16543 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDC37Q16543 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDC37Q16543 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDC37Q16543 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDC37Q16543 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDC37Q16543 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC37Q16543 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC37Q16543 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC37Q16543 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC37Q16543 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC37Q16543 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC37Q16543 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC37Q16543 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC37Q16543 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC37Q16543 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC37Q16543 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC37Q16543 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC37Q16543 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC37Q16543 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC37Q16543 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC37Q16543 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC37Q16543 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC37Q16543 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC37Q16543 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC37Q16543 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC37Q16543 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC37Q16543 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC37Q16543 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC37Q16543 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC37Q16543 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC37Q16543 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC37Q16543 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC37Q16543 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC37Q16543 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC37Q16543 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC37Q16543 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC37Q16543 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC37Q16543 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC37Q16543 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC37Q16543 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC37Q16543 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC37Q16543 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC37Q16543 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC37Q16543 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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