Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC12.77□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
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GABRA6Q16445 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
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GABRA6Q16445 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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GABRA6Q16445 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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GABRA6Q16445 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
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GABRA6Q16445 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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