Protein–RNA interactions for Protein: Q16342

PDCD2, Programmed cell death protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD2Q16342 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 OLFML2A-203ENST00000373580 6425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 FNTB-201ENST00000246166 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 AC007663.2-201ENST00000506039 2228 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 BMF-201ENST00000354670 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 MGRN1-203ENST00000415496 6405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 HLA-E-201ENST00000376630 2601 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 IGHG1-202ENST00000390548 2619 ntAPPRIS P5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 SYNE3-201ENST00000334258 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 BX324167.2-201ENST00000623717 3316 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 STRCP1-201ENST00000509801 5328 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 GRK3-201ENST00000324198 9103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 ZMIZ2-206ENST00000441627 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 CARHSP1-202ENST00000396593 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 ZNF274-210ENST00000610905 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 AC099521.2-201ENST00000619354 2036 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 EPB41L1-202ENST00000338074 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 ZSWIM3-201ENST00000255152 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 SMIM14-201ENST00000295958 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 POLD1-214ENST00000613923 3542 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.1 ms