Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 SNRPCP15-201ENST00000424055 192 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 HNRNPA1P59-201ENST00000430583 918 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 DPY19L2P4-201ENST00000479881 442 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 AC104964.1-201ENST00000520494 489 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 LINC02252-201ENST00000565706 487 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 APOO-201ENST00000379226 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 IGHV3-66-201ENST00000390632 427 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 AC004771.1-201ENST00000438266 583 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 AC079414.2-201ENST00000567157 1104 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 AC241585.2-202ENST00000621798 1015 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 LINC01002-223ENST00000633179 407 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 SPAG1-205ENST00000520508 1796 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 FDFT1-214ENST00000528812 2013 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 APOBEC3B-204ENST00000407298 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 KRT18P4-201ENST00000422599 1288 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 IGKV1D-43-201ENST00000468879 532 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 SNHG4-204ENST00000507197 865 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 HNRNPA1P5-201ENST00000558213 966 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 AC048380.1-201ENST00000589818 465 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 VSTM1-205ENST00000425006 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 AC009517.1-201ENST00000454750 570 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 AC107464.2-201ENST00000502923 569 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 AC009055.1-201ENST00000562656 781 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 MIAT_exon5_3.1-201ENST00000613656 377 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
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ZFHX3Q15911 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 PDCD6-201ENST00000264933 1135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 ID2-AS1-201ENST00000412712 953 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
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ZFHX3Q15911 GSS-202ENST00000451957 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
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ZFHX3Q15911 AC113133.1-201ENST00000522388 1088 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 RN7SL478P-201ENST00000584358 298 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 CELF4-217ENST00000591282 1461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 RN7SL128P-201ENST00000467883 305 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 AC004889.1-201ENST00000498693 856 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 AC024405.2-201ENST00000528459 810 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 AC008764.4-207ENST00000600705 956 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 IFITM2-205ENST00000602569 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 AL451165.2-201ENST00000606971 718 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
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